青海農牧科技職業學院的前身為國立青海初級實用職業學校。

1939年5月，國民政府教育部委托中央政治學校西寧分校籌建國立青海初級實用職業學校，將校址定在原貴德的佘乃亥。

1940年9月，國立青海初級實用職業學校建立，校址最初在青海貴德縣佘乃亥，9月中旬，學校首先招收少數民族新生15名，設立預科班，開學上課。

1946年，教育部派督學黃景文視察學校。黃景文在給教育部的報告中建議遷校或解散。教育部批準遷校湟源。1946年底將一部分學生遷往湟源。開始校址未定，便借用湟源城關平民工廠的40余間房屋作臨時校舍。

1947年春，繼續搬遷青海畜牧獸醫職業技術學院，在湟源城關西門外瓦窯子修建土木結構二層樓房1座，并修教室2間和其它一些房舍。

1949年9月，青海解放后，國立青海初級實用職業學校由湟源縣人民政府接管，改名為湟源縣職業學校。

1950年12月，更名為青海省湟源農牧技術學校，隸屬省畜牧廳（局）、文化廳、農牧廳共同管理。

1955年5月，學校由青海省畜牧廳主管，改名為青海省湟源畜牧學校，簡稱湟源牧校。

1957年8月，經青海省人民委員會批準，在湟源畜牧學校北院分設青海省湟源民族畜牧校，由同一黨委領導兩校。學校接管湟源縣牧場土地約53.3萬平方米，建立巴燕實習牧場。

1958年12月，湟源民族畜牧學校又奉令并入青海省湟源畜牧學校。

“文化大革命”中，學校由青海省革委會政治部文教組主管。

1992年7月，學校復歸青海省畜牧廳主管。

1984年，學校設立青海省畜牧廳成人職工中專學校。

1988年7月，干部培訓部經青海省畜牧廳批準成立。

1997年，學校設立青海省畜牧職業中專。

1998年，學校被農業部確定為“全國農業職業技術教育培訓示范基地”，設立農業行業特有工種技能鑒定站。

1999年，學校設立青海省湟源畜牧學校國家職業技能鑒定所。

2000年，學校被教育部確定為國家級重點中專學校。

2002年4月，經青海省人民政府批準改制為青海畜牧獸醫職業技術學院，學院仍隸屬省農牧廳管理。

2003年8月，學院被教育部、財政部確定為重點支持的高職院校。

2006年10月，學院在高職高專人才培養工作水平評估中被確定為“優秀”學校。

2007年，教育部、財政部批準學院成為國家重點支持“百所示范校”之一，7月，學院順利通過教育部、財政部驗收。

2011年12月，教育部新一輪人才培養工作評估學院為“通過”學校 。

2012年10月，學院成為全國11所“黃炎培優秀學校”之一。

2015年8月，學院被教育部確定為全國首批開展現代學徒制的百所試點高職院校之一。9月，以青海江河源投資集團有限公司和青海畜牧獸醫職業技術學院為依托組建的青海現代農牧業職業教育集團揭牌成立。

2016年7月，學院被省教育廳、省財政重點支持建設的青海省職業教育綜合能力提升示范院校。12月，學院被教育部入選“全國高校實踐育人創新創業基地”。

2018年12月，學院被教育部立項建設的全國首批現代學徒制試點單位驗收通過。

2020年5月，更名為青海農牧科技職業學院。

以上信息源自官網青海畜牧獸醫職業技術學院，數據截止至2023年7月，請以官網為準！