北京大學設(shè)有人文、理學、社會科學、信息與工程、醫(yī)學5個學部，62個獨立學院。

理學部：北京大學數(shù)學科學學院、北京大學物理學院、北京大學化學與分子工程學院、北京大學生命科學學院、北京大學城市與環(huán)境學院、北京大學地球與空間科學學院、北京大學心理學系、北京大學建筑與景觀設(shè)計學院、、

信息與工程科學部：北京大學信息科學技術(shù)學院、北京大學工學院、北京大學計算機科學技術(shù)研究所、北京大學軟件與微電子學院、北京大學環(huán)境科學與工程學院

人文學部北京大學中國語言文學系、北京大學歷史學系、北京大學考古文博學院、北京大學哲學系（宗教學系）、北京大學外國語學院、北京大學藝術(shù)學院、對外漢語教育學院、北京大學歌劇研究院

社會科學部：北京大學國際關(guān)系學院、北京大學經(jīng)濟學院、北京大學光華管理學院、北京大學法學院、北京大學信息管理系、北京大學社會學系、政府管理學院、北京大學馬克思主義學院、北京大學教育學院、北京大學新聞與傳播學院、北京大學人口研究所、北京大學國家發(fā)展研究院、北京大學體育教研部

醫(yī)學部：北京大學基礎(chǔ)醫(yī)學院、北京大學藥學院、北京大學公共衛(wèi)生學院、北京大學護理學院、北京大學醫(yī)學人文研究院、公共教學部醫(yī)學網(wǎng)絡(luò)教育學院、北京大學第一醫(yī)院、北京大學人民醫(yī)院、北京大學第三醫(yī)院、北京大學口腔醫(yī)院、北京大學第六醫(yī)院、北京腫瘤醫(yī)院、北京大學深圳醫(yī)院、北京大學首鋼醫(yī)院

跨學科類：北京大學元培學院、北京大學先進技術(shù)研究院、北京大學前沿交叉學科研究院、北京大學中國社會科學調(diào)查中心、北京大學分子醫(yī)學研究所、北京大學科維理天文研究所、北京大學核科學與技術(shù)研究院、北京國際數(shù)學研究中心

深圳研究生院：北京大學信息工程學院、化學生物學與生物技術(shù)學院、北京大學環(huán)境與能源學院、北京大學城市規(guī)劃與設(shè)計學院、北京大學新材料學院、北京大學匯豐商學院、北京大學國際法學院、北京大學人文社會科學學院